Об успешном проведении комиссионных испытаний методических рекомендаций по использованию высокопроизводительного секвенирования на базе референтной лаборатории вирусных болезней птиц ФГБУ «ВНИИЗЖ»

14.06.2017 16:23
На базе референтной лаборатории вирусных болезней птиц подведомственного Россельхознадзору ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» осуществлена апробация разработанных методических рекомендаций по использованию высокопроизводительного секвенирования для расшифровки вирусных геномов. Сущность разработанного метода заключается в определении пула нуклеотидных последовательностей методом секвенирования «путем синтеза» с использованием универсального метода пробоподготовки без специфичных олигонуклеотидов (праймеров) и анализом полученных данных для идентификации среди них геномных фрагментов инфекционных агентов. Особенностью данного метода, отличающего его от других разновидностей высокопроизводительного секвенирования, является использование флуоресцентно-меченых блокированных нуклеотидов. Благодаря тому, что за один цикл происходит присоединение лишь одного нуклеотида, данный метод обладает высокой точностью прочтения гомополимерных участков нуклеотидных последовательностей. Однако, в отличие от секвенирования методом Сэнгера, впоследствии происходит отщепление блокирующей части и становится возможным присоединение нового нуклеотида. В ходе испытаний была установлена возможность применения метода для секвенирования и последующего анализа как простых мелких вирусов, так и вирусов, содержащих сложные геномные повторы и регуляторные элементы.
Расширение методической базы и внедрение в лабораторную практику нового оборудования расширяет арсенал методов, которые можно задействовать в изучении микроорганизмов, что особенно важно для возбудителей особо опасных инфекций.
Пресс-служба ФГБУ «ВНИИЗЖ»