Результаты исследований ФГБУ «ВНИИЗЖ» в области полногеномного секвенирования

Сотрудниками референтной лаборатории вирусных болезней птиц подведомственного Россельхознадзору ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» успешно проведена работа по расшифровке генома вакцинного штамма вируса инфекционного ларинготрахеита (ИЛТ).

Работа выполнена с использованием методов секвенирования второго поколения. Вирус относится к семейству Herpesviridae и обладает крупным геномом (150-170 тыс.п.н.), в котором присутствуют различные регуляторные структуры, в том числе сформированные за счет сложных инвертированных повторов. Для работы сотрудниками использован вакцинный штамм «О», который выделен в 1992 г. и рекомендован в качестве производственного для изготовления вирус-вакцины против ИЛТ. Вирус адаптировали для культивирования на развивающихся куриных эмбрионах (возраст 9-11 дней).

Расшифровка вирусного генома осуществлялась методом пирофосфатного секвенирования (технология 454 Life Sciences). В результате работы получена нуклеотидная последовательность размером 153 тыс.п.н.. Первичный сравнительный анализ показал, что штамм близок к обширной группе изолятов, регистрируемых в различных странах мира.

Результаты проведенных в ФГБУ «ВНИЗЖ» исследований будут использованы для усовершенствования методов молекулярной диагностики и изучения биологических свойств инфекционного агента в России и сопредельных странах.

Пресс-служба ФГБУ «ВНИИЗЖ»