Генетическая характеристика высоковирулентного вируса гриппа Н5N1, выявленного в апреле 2023 года при вспышке заболевания в популяции диких птиц на территории Республики Калмыкия

Сотрудниками референтной лаборатории вирусных болезней птиц ФГБУ «ВНИИЗЖ» получены дополнительные результаты исследования вируса гриппа птиц подтипа Н5N1, выявленного в пробе трахеи пеликана (дата и место отбора пробы: 05 апреля 2023, Республика Калмыкия, Ики-Бурульский район, Чограйское СМО, берег реки Подманок).
При проведении сравнительного генетического анализа нуклеотидных последовательностей гена H было установлено, что выявленный вирус обладает сайтом расщепления гемагглютинина -REKRRKR-, характерным для высоковирулентных вирусов гриппа птиц и принадлежит к азиатской генетической линии ВПГП подтипа H5, клада 2.3.4.4b, получившего эпизоотическое распространение в 2016-2023 гг. в странах Азии, Европы, Африки, Южной и Северной Америки. Согласно данным международной базы GenBank, наиболее генетически близкими к выявленному изоляту вируса являются вирусы подтипа H5N1 из России, Народной Республики Бангладеш, Нигерии, Египта, Бенина; H5N5 из России и H5N8 из Египта и Нигерии, выделенные в 2021 году; подтипа H5N1 из Испании и Египта, выделенные в 2022 году (уровень сходства 100%).
Изолят вируса гриппа птиц из Республики Калмыкия генетически близок к вирусам гриппа птиц подтипа H5, выявленным в период с 2020 по 2023 гг. в различных регионах Российской Федерации. Уровень сходства (100%) наблюдается с вирусами гриппа птиц, выявленными в 2020-2022 гг. в Челябинской области; в 2020, 2022 гг. в Ростовской области, в 2021 году в Калининградской, Тюменской областях, в республиках Крым и Дагестан; в 2022 году в Московской, Рязанской, Белгородской, Самарской, Саратовской областях, Хабаровском крае; в 2023 году в Калининградской и Белгородской областях, Ставропольском крае, Республике Дагестан.
Источник фото : https://www.google.ru/imgres?imgurl=https%3A%2F%2Fbelmvl.ru%2F%25D0%25BF%25D1%2582%25D0%25B8%25D1%2587%25D0%25B8%25D0%25B9%2520%25D0%25B3%25D1%2580%25D0%25B8%25D0%25BF%25D0%25BF%25203.jpg&tbnid=Dx7U9dGLjAOHYM&vet=12ahUKEwjqh4W9w8T-AhWHtyoKHTKWDUcQMygAegUIARC1AQ..i&imgrefurl=https%3A%2F%2Fbelmvl.ru%2Fabout%2Fnewslist%2Fnews%2Fissledovaniya-po-diagnostike-grippa-pticz-v-belgorodskoj-oblasti-vedutsya-postoyanno&docid=oKNzwB33c4y8GM&w=1100&h=607&q=%D0%B8%D1%81%D1%81%D0%BB%D0%B5%D0%B4%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D1%8F%20%D0%B3%D1%80%D0%B8%D0%BF%D0%BF%D0%B0%20%D0%BF%D1%82%D0%B8%D1%86&hl=ru-ru&client=safari&ved=2ahUKEwjqh4W9w8T-AhWHtyoKHTKWDUcQMygAegUIARC1AQ